行ったり来たり
S.T.A.L.K.E.R. 2：『行ったり来たり」は、ニューゲーム開始後に始まる最初のメインクエスト。ハーマンの依頼を受けてゾーンに侵入し…
S.T.A.L.K.E.R. 2におけるメインクエストの攻略情報を紹介。プレイヤーキャラクターのスキフは、科学者ハーマンが運転するトレーラーに乗ってゾーンへ入る。スキフは科学者のグループから依頼を受けており、ハーマンから大型のスキャナーを受け取ってデータ収集のために目的地へ向かう。
メインクエスト
厳しい目覚め
S.T.A.L.K.E.R. 2：『厳しい目覚め』は、『行ったり来たり』の次に発生するメインクエスト。スキャナーを奪った犯人を捜すため、ザリ…
七つの封印の後ろに
『七つの封印の後ろに』は『行ったり来たり』の次に発生するメインクエスト。奪われたスキャナーを取り戻すため、ザリシアでハーマンを裏切ったソルダ…
干し草の針
S.T.A.L.K.E.R. 2：『干し草の針』は『七つの封印の後ろに』進行中に発生するメインクエスト。ソルダーの情報を教えてもらうため、ス…
答えには代償が伴う
『答えには代償が伴う』は『七つの封印の後ろに』の次に発生するメインクエスト。レッサーゾーンを離れ、ガーベジエリアでネスターを探す。前ミッショ…
値上がり
S.T.A.L.K.E.R. 2のメインクエスト「値上がり」は「答えには代償が伴う」の次に発生するミッション。ガーベジのリーダーであるネスタ…
悪魔との取引
S.T.A.L.K.E.R. 2：『悪魔との取引』は『値上がり』の次に発生するメインクエスト。襲撃に関わったバンディットのリーダー「ヴァラン…
キング・オブ・ザ・ヒル
S.T.A.L.K.E.R. 2：『キング・オブ・ザ・ヒル』は『悪魔との取引』から派生するメインクエスト。ヴァランから襲撃犯の情報を得るため…
再びボタ山へ
S.T.A.L.K.E.R. 2：『再びボタ山へ』は『悪魔との取引』の次に発生するメインクエスト。プラントから脱出した後、ボタ山のダイオード…
追跡劇
S.T.A.L.K.E.R. 2：『追跡劇』は『再びボタ山へ』の次に発生するメインクエスト。ヌーンタイドのリーダーと会うため、ワイルドランド…
亡霊を追って
S.T.A.L.K.E.R. 2：『亡霊を追って』は『追跡劇』の次に発生するメインクエスト。モノリスPDAからの通信を傍受するため、アジマス…
死せる周波数
S.T.A.L.K.E.R. 2：『死せる周波数』は『亡霊を追って』の次に発生するメインクエスト。ファウストが送り込んだ内通者を見つけるため…
飛んで火に入る
S.T.A.L.K.E.R. 2：『飛んで火に入る』は『死せる周波数』から派生するメインクエスト。キャンプ・イカルス周辺に設置された3つのプ…
ガイドを探して
S.T.A.L.K.E.R. 2：『ガイドを探して』は『死せる周波数』の次に発生するメインクエスト。クリアスカイ基地への行き方を教えてくれる…
星を目指す
S.T.A.L.K.E.R. 2のメインクエスト「星を目指す」は「ガイドを探して」の次に発生するミッション。ファウストがいるクリアスカイの基…
究極シンプル
S.T.A.L.K.E.R. 2：『究極シンプル』は『星を目指す』の次に発生するメインクエスト。沼地から脱出し、ファウストから取り戻したスキ…
遅すぎた来訪
S.T.A.L.K.E.R. 2：『遅すぎた来訪』は『究極シンプル』の次に発生するメインクエスト。ウォードが管轄する科学施設「SIRCAA」…
進歩の鍛冶場
S.T.A.L.K.E.R. 2：『進歩の鍛冶場』は『遅すぎた来訪』の次に発生するメインクエスト。未確認生物学およびプサイ医学研究所（ラボ）…
希望的観測
S.T.A.L.K.E.R. 2：『希望的観測』は『進歩の鍛冶場』の次に発生するメインクエスト。閉鎖区画から脱出した後、スキフはSIRCAA…
血の最後の一滴まで
S.T.A.L.K.E.R. 2：『血の最後の一滴まで』は『希望的観測』でヌーンタイドに味方した場合に発生するメインクエスト。SIRCAAか…
法と秩序
S.T.A.L.K.E.R. 2：『法と秩序』は『希望的観測』でウォードに味方した場合に発生するメインクエスト。モノリスの襲撃を受けたSIR…
古き良き時代のように
S.T.A.L.K.E.R. 2：『古き良き時代のように』は『法と秩序』または『血の最後の一滴まで』の次に発生するメインクエスト。ワイルドア…
スズメバチの巣
stalker2のメインクエスト『スズメバチの巣』は、『法と秩序』クリア後に発生するミッション。スフィアで起きたプサイ放射線の急増を調べるた…
見えざる脅威
S.T.A.L.K.E.R. 2のメインクエスト『見えざる脅威』は、『希望的観測』でウォードまたはヌーンタイドのどちらに味方したかによって内…
新たな日の黎明
S.T.A.L.K.E.R. 2：『新たな日の黎明』は『見えざる脅威』の次に発生するメインクエスト。スカーの依頼を受け、エミッターをプロミン…
ドゥーガ襲撃
S.T.A.L.K.E.R. 2：『ドゥーガ襲撃』は『見えざる脅威』『新たな日の黎明』の次に発生するメインクエスト。モノリスが占拠した旧ソビ…
些細な事件
S.T.A.L.K.E.R. 2：『些細な事件』は『ドゥーガ襲撃』の次に発生するメインクエスト。ファウストが作り出す幻影に対処する方法を知る…
過去の栄光を求めて
S.T.A.L.K.E.R. 2：『過去の栄光を求めて』は『些細な事件』の次に発生するメインクエスト。プロジェクト-Xに関わった研究者を探す…
万人の幸せ
S.T.A.L.K.E.R. 2：『万人の幸せ』はメインクエストをスパーク側で進めた場合に、『過去の栄光を求めて』の次に発生するクエスト。フ…
再び裂け目へ
S.T.A.L.K.E.R. 2：『再び裂け目へ』は、ウォード側でストーリーを進めた場合に『過去の栄光を求めて』の次に発生するメインクエスト…
真実の情景
S.T.A.L.K.E.R. 2：『真実の情景』は、『再び裂け目へ』または『万人の幸せ』の次に発生するメインクエスト。C-コンシャスネスの代…
暗き時
S.T.A.L.K.E.R. 2：『暗き時』は『真実の情景』の次に発生するメインクエスト。ストレロクの居場所を知る人物「ドクター」を探すため…
慈悲の行い
S.T.A.L.K.E.R. 2：『慈悲の行い』は『暗き時』の次に発生するメインクエスト。ストライダーを復活させるため、ケーブルトンネルでモ…
ゾーンの伝説
S.T.A.L.K.E.R. 2：『ゾーンの伝説』は『慈悲の行い』の次に発生するメインクエスト。X3とストレロクの情報を知るシドロヴィッチに…
微細物質
S.T.A.L.K.E.R. 2：『微細物質』は『ゾーンの伝説』の次に発生するメインクエスト。かつてカイマノフとその仲間たちがノウスフィア（…
危険な連絡係
S.T.A.L.K.E.R. 2：『危険な連絡係』は『微細物質』の次に発生するクエスト。STALKERプログラム制御センターの正確な位置を特…
檻からの脱出
S.T.A.L.K.E.R. 2：『檻からの脱出』は『危険な連絡係』で「逃げる」選択肢を選んだ場合に発生するメインクエスト。ウォードに捕まっ…
境界線
S.T.A.L.K.E.R. 2：『境界線』は『危険な連絡係』または『檻からの脱出』の次に発生するメインクエスト。プリピャチへ行くため、ヤニ…
ファウンデーションへの道
S.T.A.L.K.E.R. 2：『ファウンデーションへの道』は『境界線』の次に発生するメインクエスト。STALKERプログラム制御センター…
下降
S.T.A.L.K.E.R. 2：『下降』は『ファウンデーションへの道』の次に発生するメインクエスト。入手した座標をもとに、ファウンデーショ…
嵐の目
S.T.A.L.K.E.R. 2：『嵐の目』は、ウォード側でストーリーを進めた場合に『下降』の次に発生するメインクエスト。ファウンデーション…
最終段階
S.T.A.L.K.E.R. 2：『最終段階』は、ストーリーをウォード側で進めた場合の最終クエスト。アノマラス・エナジーを効率的に使う新世界…
死の影の渓谷を通って
S.T.A.L.K.E.R. 2：『死の影の渓谷を通って』は、ストーリーをスパーク側で進めた場合に『下降』の次に発生するメインクエスト。ファ…
永遠の輝き
S.T.A.L.K.E.R. 2：『永遠の輝き』は、ストーリーをスパーク側で進めた場合の最終クエスト。シャイニングを実現するため、ジェネレー…
最後の願い
S.T.A.L.K.E.R. 2：『最後の願い』は、ストレロク側で『下降』をクリアすると発生するメインクエスト。ストレロクの依頼を受け、カイ…
不満は残すな
S.T.A.L.K.E.R. 2：『不満は残すな』は、ストレロク側でストーリーを進めた場合の最後のメインクエスト。『最後の願い』でどちらの選…
ルート分岐
メインクエストは最終的に4つのルートに分かれる。
途中まではウォードとスパークのどちらかに協力してストーリーが進む。終盤の『ゾーンの伝説』以降はさらに選択肢が増え、最終的に4つのルートに分かれる。序盤はルートが変わる程度の違いしかないが、SIRCAA以降の選択はより重要性が増し、選ばなかった陣営との関係が大幅に悪化する。（敵対する場合が多い）
進行上の注意点は次の通り。🎗️：ルート分岐｜☢️：取り返しのつかない要素
- 🎗️七つの封印の後ろに：ウォードとローナーどちら側にセンサーを渡したかによって、ボタ山へ向かうルートが変化する
- 🎗️再びボタ山へ：コルシュノフにPDAを見せるかどうかで『死せる周波数』のルートが変化する
- ☢️遅すぎた来訪：SIRCAAに入るとモノリスが復活するまでストーリーが進行する。先にザリシアとシェルターのサイドクエストを終わらせておこう
- 🎗️希望的観測：ヌーンタイドとウォードのどちら側につくか選ぶ。選んだ陣営によって以降に発生するクエストが変化する
- ☢️見えざる脅威：ガファーの救援要請を放置したまま進めると、ザリシアが壊滅する
- ☢️ドゥーガ襲撃：クリアすると『封印された真実』が進められなくなる
- 🎗️微細物質：エンディングに影響する選択肢が出る
- 🎗️危険な連絡係：エンディングに影響する選択肢が出る
- ☢️下降：帰還不能地点
- 🎗️最後の願い：エンディングに影響する選択肢が出る
メインクエスト『下降』以降は帰還できなくなる。やり残したことがある場合は、下降を始める前に済ませておこう。
エンディング
Stalker2のエンディングは4種類存在する。詳細はエンディングを参照。
